開基は親鸞聖人の弟子・信願房(新田氏末裔の藤井八郎信親)であり、鎌倉時代の1256年に三河国の赤渋(現在の愛知県)に浄妙寺を建立しました。

徳川幕府の時代には譜代大名であった酒井氏や旗本の本多氏との関係が深く、両氏が上野厩橋へ移封の折に浄妙寺16代目超意の子・超宗が同行し厩橋城(前橋城)内にお堂を建て寺号を「政淳寺」と改めました。

その後、利根川の氾濫により榎町 (前橋市千代田町)へ移転、さらに昭和47年(1972年)には市中心部の発展のため田口町へ移り、現在に至ります。

境内には「日本近代詩の父」とも呼ばれる詩人・萩原朔太郎の墓地があることでも知られています。